Новелла повествует о десятикласснике Юги Муто, который однажды собрал Загадку Тысячелетия, в которой долгое время была заточена душа Безымянного фараона, потерявшего свою память. Теперь в сердце Юги поселилась душа, Король игр, перенимающая контроль над телом мальчика в моменты опасности и глубоких душевных потрясений.
Первые три главы основаны на оригинальной истории манги Yu-Gi-Oh!, однако четвертая — уникальна. В ней Королю игр предстоит сразиться с Кибер-Кайбой, загадочным терминалом, подключенным к суперкомпьютеру и призванным заменять настоящего Сето Кайбу, пока тот был не в состоянии руководить своей компанией. Кибер-Кайба желал превзойти своего создателя, но для абсолютной победы ему нужна была дуэль с Юги. А Юги хотел вернуть своего настоящего соперника...